São Pedro de Agostém foi vigararia da apresentação da mitra bracarense ou, segundo a estatistica paroquial de 1862, do Cabido, tornando-se posteriormente reitoria.

Num documento da primeira metade do século XII faz-se referência à freguesia e seu couto, como pertencentes ao arcebispado de Braga. Freguesia do concelho de Chaves composta pelos lugares de Agostém, Bóbeda, Escariz, Lagarelhos, Paradela de Veiga, Pereira de Veiga, São Pedro de Agostém, Sesmil, Ventozelos, Vila Nova de Veiga e Peto de Lagarelhos.

A paróquia de São Pedro de Agostém pertence ao arciprestado de Chaves e à diocese de Vila Real, desde 22 de Abril de 1922. O seu orago é São Pedro.